ઉપરાષ્ટ્રપતિ જગદીપ ધનખડના અચાનક રાજીનામાનું સૌથી મોટું કારણ સામે આવ્યું ; જગદીપ ધનખડેએ સરકારને અંધારામાં રાખીને એક કામ એવું કર્યું કે જેને કારણે તેમને રાજીનામું આપવાની નોબત આવી છે ,
લોકસભામાં પ્રસ્તાવ રજૂ કરવાની સરકારની યોજનાની વિરુદ્ધ પણ ગયો હતો, જેના પર વિપક્ષી સાંસદોને પણ સહમતિ આપવામાં આવી હતી. સરકાર નારાજ હતી કારણ કે તેણે ન્યાયતંત્રમાં ભ્રષ્ટાચાર પર મજબૂત વલણ અપનાવ્યું હતું અને ધનખડના પગલાથી આ મુદ્દા પર તેના નેતૃત્વને પાતળું કરવાનું જોખમ હતું.

ઉપરાષ્ટ્રપતિ જગદીપ ધનખડે શરીર સારુ રહેતું નથીનું કારણ આપીને રાજીનામું આપી દીધું છે પરંતુ આ તો ઉપરની વાત અંદરખાને બીજુ જ રંધાયું છે જે હવે સામે આવ્યું છે. એવું બહાર આવ્યું છે કે જગદીપ ધનખડેએ સરકારને અંધારામાં રાખીને એક કામ એવું કર્યું કે જેને કારણે તેમને રાજીનામું આપવાની નોબત આવી હતી. ચર્ચાઈ રહ્યું છે કે જગદીપ ધનખડેએ હાઈકોર્ટના જસ્ટિસ યશવંત વર્મા (જેમના ઘેરથી કરોડની રોકડ મળી આવી હતી) ને હટાવવા માટેની વિપક્ષની દરખાસ્ત સ્વીકારી લીધી હતી અને સરકારને જાણ કરી નહોતી, આમ તો સરકાર પણ જસ્ટિસ વર્માને હટાવવા માગતી હતી અને તેનો યશ તે લેવા માગતી હતી પરંતુ યશ લઈ ગયા વિપક્ષવાળા એટલે સરકાર ધનખડ પર ગિન્નાઈ અને તેમને રાજીનામું આપી દેવાનું કહ્યું હોવાનું ચર્ચાઈ રહ્યું છે.
સૂત્રોએ જણાવ્યું હતું કે ધનખડે માત્ર વિપક્ષી સાંસદોના જસ્ટિસ વર્મા વિરુદ્ધના પ્રસ્તાવને સ્વીકાર્યો જ નહીં પરંતુ સરકારને પણ આ અંગે અંધારામાં રાખી હતી. જો સરકારને જાણ કરવામાં આવી હોત, તો શાસક પક્ષના સાંસદોએ પણ પ્રસ્તાવ પર હસ્તાક્ષર કર્યા હોત. આ નિર્ણય લોકસભામાં પ્રસ્તાવ રજૂ કરવાની સરકારની યોજનાની વિરુદ્ધ પણ ગયો હતો, જેના પર વિપક્ષી સાંસદોને પણ સહમતિ આપવામાં આવી હતી. સરકાર નારાજ હતી કારણ કે તેણે ન્યાયતંત્રમાં ભ્રષ્ટાચાર પર મજબૂત વલણ અપનાવ્યું હતું અને ધનખડના પગલાથી આ મુદ્દા પર તેના નેતૃત્વને પાતળું કરવાનું જોખમ હતું.
ઉપરાષ્ટ્રપતિએ વિપક્ષના પ્રસ્તાવને સ્વીકાર્યા પછી, વડા પ્રધાન નરેન્દ્ર મોદી સાથે વરિષ્ઠ પ્રધાનોની બેઠક યોજાઈ હતી. 10-10 ના જૂથમાં ભાજપના સાંસદોને બોલાવવામાં આવ્યા હતા અને તૈયાર રાખેલા એક મહત્વપૂર્ણ પ્રસ્તાવ પર સહી કરવા માટે કહેવામાં આવ્યું હતું. આ જૂથો ગયા પછી, ભાજપના નેતૃત્વ હેઠળના એનડીએના અન્ય સભ્યોના સાંસદોની પણ સહીઓ માંગવામાં આવી હતી. બધા સાંસદોને આ પ્રસ્તાવ અંગે મૌન રહેવા કહેવામાં આવ્યું હતું અને, મહત્ત્વનું એ છે કે, તેમને આગામી ચાર દિવસ દિલ્હીમાં રહેવાનું કહેવામાં આવ્યું હતું. ત્યારબાદ ઉપરાષ્ટ્રપતિ ધનખરને આ પ્રસ્તાવ અને સાંસદોએ તેના પર સહી કરી દીધી હોવાની માહિતી આપવામાં આવી.
ઉલ્લેખનીય છે કે મંગળવારે ઉપરાષ્ટ્રપતિ જગદીપ ધનખડે અચાનક રાજીનામું આપી દીધુ હતું. રાજીનામું આપવા પાછળનું કારણ હેલ્થ જણાવાયું હતું જોકે અસલમાં તેમના ગુપ્ત કામથી નારાજ સરકારે તેમને રાજીનામું લઈ લીધું હોવાનું ચર્ચાઈ રહ્યું છે.